Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät

Institut für Biowissenschaften

Fachgebiet: Mikrobiologie

Betreuer: Prof. Dr. Stephan Schaefer



MSc Saijo Thomas
(e-mail: saijo.thomas@uni-rostock.de )

Positive stranded RNA viruses: Dissecting the capsid of Hepatitis E and Chikungunya viruses

Summary: Capsid protein of two positive stranded RNA viruses, Hepatitis E virus (HEV) and Chikungunya virus (ChikV) were investigated. HEV was detected in swine serum collected in Germany. I also expressed HEV capsid in various expression systems for its possible use as a vaccine candidate. An infectious system for HEV was established and was used to check its egress. The requirement of various amino acid sequences for the autoproteolytic cleavage of ChikV capsid protease was investigated. Our analysis shows that amino acids other than the catalytic triads are important for the activity. I was also able to show that ChikV capsid is recognized by karyopherins and its export is mediated by CRM1 dependent nuclear export signal.

Zusammenfassung: Kapsidprotein zweier RNA-Viren mit positiver RNA-Strang-Polarität, Hepatitis E Virus (HEV) und Chikungunya-Virus (ChikV) wurden untersucht. HEV wurde in Schweine-Serum detektiert. Ich benutzten verschiedene Systeme zur Expression des HEV Kapsids um seine mögliche Verwendung als Impfstoff-Kandidat zu testen. Ein infektiöses HEV-System wurde etabliert um die Virus-Freisetzung zu überprüfen. Der Einfluss verschiedener Aminosäuresequenzen auf die autoproteolytische Spaltung der ChikV-Kapsidprotease wurde untersucht. Wichtig für die Aktivität sind neben den katalytischen Triaden andere Aminosäuren. Ich konnten zeigen, dass das Kapsid von Karyopherinen erkannt und seine Ausfuhr vom CRM1-abhängigen Kernexportsignal vermittelt wird.