Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät

Institut für Biowissenschaften

Fachgebiet: Mikrobiologie

Betreuer: Prof. Dr. Stephan Schaefer



MSc Lijo John
(e-mail: lijo.john@uni-rostock.de )

Identification of host cellular requirements for positive strand RNA viruses: Hepatitis C virus and hepatitis E virus

Summary: All viruses require specific host factors in each phase of their life cycle. Investigation of the cellular requirements of two positive strand RNA viruses, by microarray, phospho-proteome array and by siRNA screening identified differential expression of important host cellular target genes. For Hepatitis C virus we used synchronized infection. We identified differential expression of host genes during viral entry and analyzed the cellular effects induced by the over expression of HCV NS4B protein. Our analysis suggests that NS4B regulates a newly identified oncogenic pathway. For hepatitis E virus, I looked for the cellular effects conferred by the capsid protein ORF2 which is known to cause endoplasmic reticulum stress in cells. I was able to show that ORF2 induced activation of CHOP did not lead to apoptosis which might be due to the up regulation of anti-apoptotic chaperones like Hsp72.

Zusammenfassung: Alle Viren sind auf zelluläre Faktoren angewiesen, um zu replizieren. Zur Identifikation zellulärer Partner zweier Plusstrang-RNA Viren wurden Microarray-, Phosphoproteomanalyse und SiRNA-Screening eingesetzt. Hierdurch wurden verschiedene differentiell exprimierte zelluläre Gene identifiziert. Durch synchronisierte Infektion durch das Hepatitis C Virus wurden Gene identifiziert, die HCV für die Internalisation benötigt. Das HCV Protein NS4B führt nach Transduktion durch adenovirale Vektoren zur Aktivierung onkogener Signalwege. Das Kapsidprotein ORF2 des Hepatitis E Virus führt zu intrazellulärem endoplasmatischen Stress. Ich konnte zeigen, dass ein wichtiges Gen für endoplasmatischen Stress – CHOP – durch ORF2 direkt aktiviert wird. Zusätzlich führt die Aktivierung und direkte Bindung des Co-Chaperons Hsp72 durch ORF2 zur Deaktivierung proaptotischer Signale und sichert somit das Überleben HEV-infizierter Zellen.