Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät

Institut für Biowissenschaften

Fachgebiet: Molekularbiologie/Genetik

Betreuer: Prof. Dr. Tom Goldammer



Dipl.-Biol. Judith Köbis
(e-mail: koebis@fbn-dummerstorf.de )

Charakterisierung von Genen des angeborenen Immunsystems in der Regenbogenforelle (Oncorhynchus mykiss) nach holistischer Transkriptomanalyse in der Milz

Die Arbeit leistet einen Beitrag zur Aufklärung von Mechanismen des angeborenen Immunsystems. Ein Microarray-Experiment erbrachte u.a. den Nachweis geringer exprimierter Komplementgene in der Milz zweier Regenbogenforellenlinien mit unterschiedlicher Robustheit. Dreizehn immunrelevante Gene wurden für funktionale Analysen ausgewählt. Für acht dieser Gene erfolgte erstmals eine Strukturanalyse in der Regenbogenforelle und anschließende Annotation der cDNA-Sequenzen. Expressionsstudien in der Milz, den Kiemen und der Leber gesunder Tiere wurden auf weitere Gene der Komplementkaskade ausgeweitet. Die Daten zeigten eine generell geringere Expression der Komplementgene in der Milz der BORN-Forellen. Expressionsanalysen nach Pathogeneinfluss zeigten eine stärkere Regulation der Gene in den Kiemen der BORN-Forellen. Zusätzlich wurde die Eignung der Zelllinie RTgill-W1 für immunologische Untersuchungen gezeigt.

This work expands the knowledge of innate immune system processes of rainbow trout. A microarray experiment showed among others different expressed complement genes between two rainbow trout lines differing in robustness. Thirteen immune relevant genes were selected for further functional analyses. A sequence analysis and annotation of cDNA sequences was conducted for eight of them first time in rainbow trout. Expression analyses in spleen, gills and liver of healthy trout of both lines were expanded to all so far known complement genes in rainbow trout. Data showed a generally lower expression of genes in spleen of BORN trout. After an infection, regulation of complement genes in BORN trout was stronger compared to TCO trout. Additionally, potential of cell line RTgill-W1 for immunological investigations was confirmed.