Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät

Institut für Biowissenschaften

Fachgebiet: Molekularbiologie

Betreuer: PD Dr. Tom Goldammer



M.Sc. Andreas Borchel
(e-mail: borchel@fbn-dummerstorf.de )

Charakterisierung von Transkriptom und Phänotyp different robuster Zuchtlinien der Regenbogenforelle mit Fokus auf das Kreatin-System der Fische

Im Rahmen dieser Arbeit wurden zwei different robuste Zuchtlinien der Regenbogenforelle (Oncorhynchus mykiss) hinsichtlich ihres Transkriptoms und ihres Phänotyps miteinander verglichen. Holistische Transkriptomanalysen basierend auf DNA-Chips und Mikrofluid-Chip-basierter Echtzeit-PCR zeigten, dass die vier Gene CEPT1A, GIMAP7, RARRES3 sowie TPM1A unter verschiedenen Umweltbedingungen in mehreren Geweben eine differente Expression aufweisen. Dies macht sie zu möglichen Kandidatengenen im Zusammenhang mit der differenten Robustheit der Fische. Eine detaillierte Untersuchung der Genexpression von Genen des Kreatinsystems erbrachte Hinweise auf Unterschiede hinsichtlich der Funktionsfähigkeit dieses zellulären Energie-Puffers. Da zusätzliche Unterschiede in Wachstum und Verhalten der Fische gefunden wurden, zeigten sich insgesamt Unterschiede sowohl auf Transkriptom- als auch auf Phänotyp-Ebene.

In this work two strains of rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) varying in their robustness were compared concerning their transcriptome and phenotype. Holistic transcriptome analyses based on microarrays and microfluidics-based real-time PCR showed that the four genes CEPT1A, GIMAP7, RARRES3 and TPM1A are differently expressed under various environmental conditions in several tissues. This made them candidate genes in relation to the different robustness of the fish. A detailed examination of the expression of genes of the creatine system indicated that there is also a difference in the functionality of this cellular energy buffer. As additional differences were found concerning behavior and growth of both strains, altogether differences on transcriptome and phenotype level became apparent.