The objective of this work was the elucidation of the biosynthesis of the secondary metabolite sodorifen, which is emitted by the bacterium S. plymuthica 4Rx13. Therefore, the genome of S. plymuthica 4Rx13 was compared to other sodorifen-producer and non-producer. Additionally, the transcriptome of the isolate 4Rx13 and the non-producer isolate AS9 were analyzed. It was speculated that genes, which are involved into the biosynthesis of sodorifen show a higher expression and are absent in the non-producer strains. The combination of genome and transcriptome data led to a list of potential candidate genes, which were checked for their functional involvement into the biosynthesis by mutagenesis. Consequently, a cluster of four genes, which is responsible for the biosynthesis of sodorifen, was located and further investigated.
In der Arbeit sollte die Biosynthese von dem flüchtigen Sekundärmetabolit Sodorifen aufgeklärt werden, der von dem Bakterium S. plymuthica 4Rx13 emittiert wird. Dazu wurde das Genom von S. plymuthica 4Rx13 mit anderen Bakterien, die ebenfalls in der Lage sind Sodorifen zu produzieren, als auch mit Nicht-produzenten verglichen. Zusätzlich wurde das Transkriptom vom Isolat 4Rx13 mit dem Nicht-produzenten Isolat AS9 analysiert. Es wurde spekuliert, dass Gene, die in die Sodorifen Biosynthese involviert sind eine hohe Expression aufweisen und in den Nicht-produzenten fehlen. Somit konnte durch die Kombination aus Genom-und Transkriptomdaten eine Liste von potentiellen Kandidatengenen erstellt werden, die hinsichtlich ihrer Funktion in der Biosynthese durch Mutagenese überprüft wurden. Folglich konnte eine Cluster bestehend aus vier Genen ausfindig gemachten werden, die an der Sodorifen Biosynthese beteiligt sind und innerhalb der Arbeit genauer untersucht wurden.